SMPN 1 Patimuan berdiri pada tanggal 07 November 1983 dengan nomor SK 0472/0/1983 sebagai Unit Gedung Baru (UGB) dengan nama SMPN 1 Kedungreja. Adapun Plt. Kepala sekolahnya adalah bapak Suhud yang menjabat Kepala SMPN 2 Sidareja. Setelah kepengurusan bapak Suhud digantikan oleh Bapak Dartun menjabat sebagai kepala sekolah. Kemudian digantikan oleh bapak Hadi Sanyoto. Ketika bapak Hadi Sanyoto pengsiun digantikan oleh bapak Imam suharsono dari SMPN 2 Sidareja sebagai Plt dari tahun 1993 - April 1994.
Pada bulan juli 1994 bapak Drs. Tarjuki, MM.Pd. menjabat sebagai kepala sekolah yang baru sampai pada 1997. Pada masa kepemimpinan beliau tepatnya tahun ajaran 1994/1995 nama Sekolah Menengah Pertama (SMP) berubah nama menjadi Sekolah Lanjutan Tingkat Pertama (SLTP) sehingga SMPN 1 Kedungreja Menjadi SLTPN 1 Kedungreja.
Pada tahun 1998 bapak Drs. H. Marno menjabat menjadi kepala sekolah. Ketika masa jabatan beliau nama SLTPN 1 Kedungreja berubah menjadi SLTPN 1 Patimuan dikarenakan adanya pemekaran dari kecamatan Kedungreja menjadi dua dengan kecamatan Patimuan dan sekolah berada di wilayah kecamatan Patimuan.
Pada tahun 2003 bapak H. Ngadino, MM menjabat sebagai kepala sekolah. pada masa kepemimpinan beliau ini SLTP berubah kembali menjadi SMP dan nama sekolah pun berubah menjadi SMPN 1 Patimuan sampai sekarang.
Selanjutnya bapak Suyana, S.Pd., MM.Pd menjabat sebagai kepala sekolah dari tahun 2007 sampai dengan 2014 dan digantikan oleh bapak H.Yusup, S.Pd. dari tahun 2014 sampai 2018.
Kemudian dari tahun 2019 bapak Risto, S.Pd., M.Pd. menjabat sebagai kepala SMPN 1 Patimuan.